
2020-3-20 12:11 |
Он нашел 77 потенциальных соединений, которые могут блокировать новый коронавирус.
Биофизики из Университета Теннеси начали использовать созданный IBM суперкомпьютер SUMMIT для просеивания тысяч молекул и поиска потенциальных соединений, которые можно было бы использовать как новый препарат против коронавируса, который отвечает за текущую пандемию коронаирусной болезни COVID-19.
Об этом пишет IFLScience.
После нескольких дней вычислений суперкомпьютеру удалось найти по меньшей мере 77 соединений, которые потенциально могли бы предотвратить заражение коронавирусом человеческих клеток.
Полученные результаты были недавно опубликованы в работе, доступной на сервере предпечати ChemRxiv. Это означает, что документ ожидает экспертной оценки, поэтому исследование следует считать "незавершенным процессом".
Поверхности коронавирусов покрыты колоскоподобными белками, напоминающие колосок (отсюда и название), что позволяет вирусам связываться с человеческими клетками и заражать их, создавая замок. Понимая белки вирусов и рецепторы клеток хозяев - человека, а также способ взаимодействия с ними других химических соединений, можно выяснить, какие лекарства могут быть эффективными против возбудителя.
SUMMIT был использован для глубокого анализа базы данных из более 8000 соединений, которые известны из имеющихся лекарственных средств, химикатов, растительных лекарств и природных продуктов. Его работа заключалась в выявлении соединений, которые, пожалуй, способны связываться с пиками белка SARS-CoV-2, блокируя тем самым ключ вируса и теоретически предотвращая его проникновение в клетки организма.
"На это у нас ушел день-два, тогда как на обычном компьютере понадобились бы месяцы", - заявил автор исследования, директор Центра молекулярной биофизики университета Теннесси Джереми Смит.
Конечно, нет никакой гарантии, что любое соединение, найденное суперкомпьютером, будет эффективным на практике. Кроме того, как и любое лекарство, оно требует широкого тестирования и клинических испытаний, прежде чем оно будет рассматриваться как жизнеспособное лечение. Однако работа суперкомпьютера помогла определить нескольких перспективных кандидатов для исследователей.
"Наши результаты не означают, что мы нашли лекарство от COVID-19. Однако мы очень надеемся, что наши вычислительные выводы будут информировать будущие исследования, и обеспечат основу, которую эксперименталисты будут использовать для исследования этих соединений и в дальнейшем. Только тогда мы узнаем, имеет ли кто-то из них характеристику, необходимую для смягчения этого вируса", - сказал Смит.
SUMMIT считается "Формулой 1" среди суперкомпьютеров. Суперкомпьютер, размещенный в Национальной лаборатории Оук-Ридж в штате Теннесси, размером с два теннисных корта, способен обрабатывать более 200 квадриллионов вычислений в секунду. Его используют различные исследователи для разных благородных миссий: от моделирования супернов и окружающей среды до обработки данных о раке и генетике.
Это исследование не впервые использует компьютеры для поиска новых лекарств. Только в прошлом месяце исследователи применили новый компьютерный алгоритм, чтобы просеять огромный цифровой архив из более 100 миллионов химических соединений и обнаружили молекулу, которая, казалось, обладает некоторыми очень замечательными свойствами антибиотиков.
Напомним, вспышка вируса началась с рынка морепродуктов и животных в китайском городе Ухань. Он вызывает симптомы, похожие на простуду, но быстро поражает легкие и другие органы. Патоген принадлежит к большой семье коронавирусов. Болезнь распространилась уже на десятки стран.
Всемирная организация здравоохранения дала официальное название новому убийственном коронавирус из Китая - COVID-19. В самом Китае его раньше назвали NCP (Novel Coronavirus Pneumonia), что означает - пневмония, которая вызывается новым типом коронавируса. Первая вакцина от этого типа коронавируса появится не раньше, чем через полтора года.
Похоже, источником вспышки коронавируса является какое-то животное. В то же время известно, что вирус может передаваться и от человека человеку воздушно-капельным путем. Есть подозрения, что болезнь может передаваться даже в инкубационный период, когда ее носитель не подозревает, что инфицирован.
В Украине 3 марта заместитель министра здравоохранения Виктор Ляшко заявил, что в Черновцах зафиксировали первый случай заражения COVID-19. Заражение обнаружили у мужчины, который вернулся из Италии. Вечером 12 марта в Украине официально подтвердили еще два случая заражения коронавирусом. Инфицирования были зафиксированы в Черновицкой и Житомирской областях. Женщина с Житомирщины умерла от инфекции, став первой жертвой COVID-19 в Украине. В Черновицкой области 16 марта лабораторно подтвердились еще два случая заражения новым коронавирусом.
Базовые рекомендации для избежания заражения коронавирусом:
избегать контактов с животными;
не есть сырое или плохо обработанное мясо;
избегать контактов с людьми, у которых есть признаки заболевания;
регулярно и тщательно мыть руки.
Что известно о загадочном недуге, как он возник и почему вызывает беспокойство у медиков – читайте в материале ТСН.uа.
Подробнее читайте на ru.tsn.ua ...